Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MDH1P40925 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MDH1P40925 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MDH1P40925 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MDH1P40925 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MDH1P40925 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MDH1P40925 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MDH1P40925 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MDH1P40925 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MDH1P40925 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MDH1P40925 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MDH1P40925 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MDH1P40925 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MDH1P40925 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MDH1P40925 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MDH1P40925 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MDH1P40925 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms