Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LTBRP36941 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LTBRP36941 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LTBRP36941 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LTBRP36941 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LTBRP36941 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LTBRP36941 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LTBRP36941 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LTBRP36941 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LTBRP36941 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LTBRP36941 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms