Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TGFBR1P36897 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms