Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms