Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5DP30049 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms