Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBL1P28749 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBL1P28749 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBL1P28749 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms