Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms