Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTX3P26022 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTX3P26022 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTX3P26022 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTX3P26022 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTX3P26022 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PTX3P26022 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTX3P26022 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTX3P26022 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTX3P26022 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTX3P26022 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTX3P26022 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms