Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA3P25788 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms