Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNCP24863 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNCP24863 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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