Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PTPRBP23467 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PTPRBP23467 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PTPRBP23467 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PTPRBP23467 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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PTPRBP23467 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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PTPRBP23467 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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