Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PVALBP20472 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PVALBP20472 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PVALBP20472 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms