Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPCAMP16422 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPCAMP16422 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms