Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CTLA4P16410 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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