Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC172P0C7W6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms