Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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