Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAVP06756 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms