Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APODP05090 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APODP05090 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APODP05090 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms