Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPBO95292 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPBO95292 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPBO95292 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPBO95292 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPBO95292 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPBO95292 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPBO95292 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPBO95292 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPBO95292 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPBO95292 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPBO95292 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPBO95292 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPBO95292 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPBO95292 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPBO95292 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPBO95292 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAPBO95292 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms