Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR47O94967 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR47O94967 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR47O94967 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR47O94967 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR47O94967 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR47O94967 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR47O94967 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR47O94967 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR47O94967 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR47O94967 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR47O94967 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR47O94967 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR47O94967 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR47O94967 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR47O94967 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR47O94967 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR47O94967 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR47O94967 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
WDR47O94967 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR47O94967 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR47O94967 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms