Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCATO75600 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCATO75600 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms