Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms