Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAG9O60271 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPAG9O60271 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms