Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DENRO43583 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DENRO43583 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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