Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHF1O43189 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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PHF1O43189 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHF1O43189 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHF1O43189 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PHF1O43189 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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