Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBDO15205 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBDO15205 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBDO15205 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBDO15205 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBDO15205 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms