Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNMO15061 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNMO15061 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNMO15061 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNMO15061 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNMO15061 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNMO15061 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNMO15061 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNMO15061 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNMO15061 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNMO15061 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNMO15061 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNMO15061 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNMO15061 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNMO15061 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNMO15061 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNMO15061 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNMO15061 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNMO15061 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNMO15061 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNMO15061 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNMO15061 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNMO15061 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNMO15061 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNMO15061 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNMO15061 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNMO15061 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNMO15061 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms