Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRTO14522 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms