Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms