Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 F2R-201ENST00000319211 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms