Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf47A7E2U8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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