Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOLGA6L4A6NEF3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms