Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIPSLA2A3N6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms