Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPDC1A2A3K4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms