Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CHMP3Q9Y3E7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms