Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BRPF3Q9ULD4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms