Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS7AQ9UBW8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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