Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PEMTQ9UBM1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PEMTQ9UBM1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms