Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPNE7Q9UBL6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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