Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUCLA2Q9P2R7 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms