Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REREQ9P2R6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REREQ9P2R6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms