Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CC2D2AQ9P2K1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CC2D2AQ9P2K1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms