Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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USP35Q9P2H5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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USP35Q9P2H5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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USP35Q9P2H5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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USP35Q9P2H5 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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USP35Q9P2H5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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USP35Q9P2H5 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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