Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE4

CCDC87, Coiled-coil domain-containing protein 87, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC87Q9NVE4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC87Q9NVE4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms