Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms