Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MMP26Q9NRE1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms