Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F12Q9HCS2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms