Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 AC090680.1-201ENST00000464696 860 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC24A3Q9HC58 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 LINC00538-201ENST00000626109 1906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC24A3Q9HC58 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms