Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NRDE2Q9H7Z3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms