Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZYG11BQ9C0D3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms